中医针灸师证发证单位是指在中医针灸领域具有权威资质的机构，负责对申请中医针灸师资格的人员进行考核、认证和发证，中医针灸师证发证单位主要包括国家中医药管理局、各省市中医药管理部门以及一些专业的中医药院校等。
国家中医药管理局是中华人民共和国国务院直属事业单位，负责全国中医药事业的管理和监督工作，国家中医药管理局下设多个部门，如针灸临床研究所、中药资源研究所等，这些部门负责中医针灸师的培训、考核和发证工作，国家中医药管理局还会定期组织中医针灸师资格考试，选拔合格的中医针灸师。
各省市中医药管理部门也是中医针灸师证发证的主要单位，这些部门在国家中医药管理局的指导下，负责本地区的中医针灸师培训、考核和发证工作，各地中医药管理部门会根据本地实际情况，制定相应的培训计划和考核标准，确保中医针灸师的专业素质得到提高。
一些专业的中医药院校也承担着中医针灸师证发证的任务，这些学校通常设有中医药专业，培养具备扎实中医药理论基础和实践技能的中医针灸师，在学校期间，学生需要学习中医基础理论、针灸技术、推拿按摩等内容，并通过学校的考核，获得中医针灸师资格证书。
中医针灸师证发证单位在保证中医针灸师队伍的专业素质和能力方面发挥着重要作用，通过对申请者的培训、考核和发证，可以确保中医针灸师能够为患者提供高质量的医疗服务，促进中医药事业的发展。
