家庭教育指导师证书的颁发机构通常是由国家认可的职业技能鉴定机构或者教育部门授权的专业培训机构，在中国，这一领域的主要权威认证机构是中国关心下一代工作委员会、中国家庭文化研究会、中国教育学会等社会团体，以及人力资源和社会保障部认定的相关职业技能鉴定所。
以中国关心下一代工作委员会为例，它是中国最具影响力的青少年和儿童权益保护组织之一，其下设的家庭教育指导师培训项目，旨在培养专业的家庭教育指导人才，为广大家长提供科学、有效的家庭教育方法和策略，通过系统的理论学习和实践操作，学员在掌握家庭教育基本理论知识的同时，也能提升实际指导能力，完成规定课程并通过考核后，将由该委员会颁发“家庭教育指导师”证书，此证书在全国范围内具有较高的权威性和公信力。
各地也会有一些由政府教育部门或高校设立的家庭教育指导师培训项目，这些项目的证书也是得到官方承认的，一些师范大学可能会开设相关课程，并在学生完成学业并通过考核后，由学校颁发相应的专业证书。
需要注意的是，随着家庭教育越来越受到重视，市场上也出现了许多非正规的培训和发证机构，家长和学员在选择时一定要谨慎，确保证书的合法性与含金量，选择权威、有资质的机构进行学习和考取证书至关重要，这不仅保证了学习内容的专业性，也为未来职业发展提供了坚实的基础。
