国际贸易单证员证书的考试科目主要围绕着国际商务的基本理论知识、操作流程和专业技能进行设置，这个证书的考核旨在确保持有者具备处理国际贸易中各种单据的能力，理解并能执行相关的国际规则和惯例。
基础理论部分是必不可少的，包括国际贸易基础知识，如国际贸易术语（FOB, CIF等），国际贸易法律与法规，国际结算方式（信用证、托收等）以及国际商法等，这些理论知识为考生提供了理解国际贸易运作框架的基础。
实践操作类科目占据重要地位，比如缮制各类国际贸易单据，如商业发票、装箱单、提单、原产地证明等，还包括了信用证的操作，保险单据的处理，报关与报检流程，以及国际货物运输和仓储管理等相关内容，这些都是国际贸易单证员日常工作中必须掌握的核心技能。
再次，计算机应用能力也是考试的一部分，主要考察使用相关软件进行电子单证处理的能力，例如ERP系统、电子报关系统等，体现了现代国际贸易对数字化和信息化的需求。
外语能力也是重要的考量因素，尤其是英语，因为大部分国际贸易文件都是以英文为主，阅读理解及书写英文单据的能力在考试中占有一定比重。
国际贸易单证员证书考试的内容全面且深入，不仅要求考生具备扎实的理论知识，更强调实际操作能力和应变能力，通过这样的考试，可以有效提升从业人员的专业素质，促进国际贸易业务的顺利进行。
