中医理疗师证书的颁发机构主要由中国国家卫生健康委员会及其授权的相关部门和机构负责，具体来说，主要有以下几个途径：
由国家中医药管理局主导的全国性考试，即“中医养生保健服务人员职业能力评价”考试，通过这个考试并达到相应标准的考生，可以获得由国家卫生健康委员会职业技能鉴定指导中心颁发的《中医养生保健服务人员》职业资格证书，其中就包括了中医理疗师的认证。
一些省级或市级的卫生健康部门也会组织相关的培训和考核，合格者将获得由该部门颁发的中医理疗师证书，这些证书在当地范围内具有法律效力，并被行业内广泛认可。
一些高等中医药院校、研究机构以及有资质的社会培训机构，也会提供中医理疗师的专业培训，并在学员完成课程并通过考核后，颁发相应的结业证书或者专业技能证书，但这类证书并不等同于国家职业资格证书，其效力可能仅限于特定区域或者特定行业。
值得注意的是，随着我国对中医药行业的规范管理，获取中医理疗师证书的要求越来越严格，不仅需要具备一定的理论知识，还需要有一定的实践经验，且必须通过正规渠道进行学习和考试，持有证书的人也需要定期参加继续教育，以保持其专业知识的更新和提升。
中医理疗师证书的颁发机构多元，但无论哪种方式取得的证书，都需保证其权威性和合法性，以确保公众在接受中医理疗服务时的安全和质量。
