家庭教育指导师证书的发放机构主要是由国家认可的职业技能鉴定机构和教育部门授权的专业培训机构，在中国，这个领域的主要权威发证机构是中国家庭文化研究会、中国关心下一代工作委员会、人力资源和社会保障部等。
中国家庭文化研究会是专门从事家庭文化研究、推广和教育的重要社会团体，他们所颁发的家庭教育指导师证书具有很高的专业性和权威性，得到了社会各界的广泛认可，其认证体系严谨，培训课程内容丰富，涵盖了儿童心理发展、亲子关系构建、家庭教育策略等多个方面，旨在提升家庭教育指导师的专业素养和服务质量。
中国关心下一代工作委员会作为我国关心青少年健康成长的重要平台，也参与到家庭教育指导师的培养与认证中来，他们的证书更注重实践操作能力和爱心责任的培养，强调在实际工作中对家长进行科学、有效的家庭教育指导。
人力资源和社会保障部则是国家层面的职业技能鉴定和管理机构，他们通过职业技能鉴定中心，依据国家职业标准，对各类职业人员进行考核评价，颁发相应的职业资格证书，家庭教育指导师作为新兴的职业之一，也在其认证范畴之内。
这些机构颁发的家庭教育指导师证书，不仅是个人专业能力的证明，也是市场就业和职业发展的通行证，持有该证书的从业人员，不仅能在学校、社区、教育咨询机构等场所提供专业的家庭教育咨询服务，也能在相关领域的研究、教学、培训等方面发挥重要作用，推动我国家庭教育事业的发展。
