家庭教育指导师证书是由多个机构和部门颁发的，包括但不限于以下几个方面：
1、国家人力资源和社会保障部：国家人力资源和社会保障部是国家级的行政机关，负责制定和实施国家职业资格证书制度，家庭教育指导师证书属于职业技能等级证书，由该部门负责颁发。
2、中国职业技能鉴定指导中心：中国职业技能鉴定指导中心是一个全国性的职业技能鉴定机构，负责组织和管理全国范围内的职业技能鉴定工作，家庭教育指导师证书也是由该中心负责颁发的。
3、各省级人力资源和社会保障厅：各省、自治区、直辖市级人力资源和社会保障厅也会根据国家相关规定，结合本地实际情况，开展家庭教育指导师职业资格认证工作，并颁发相应的证书。
4、各地市级以上人才市场：各地市级以上人才市场作为政府部门下设的服务机构，也会承担一定的家庭教育指导师职业资格认证工作，并颁发相应的证书。
5、一些专业的培训机构或学会：一些专业的培训机构或学会也会开设家庭教育指导师培训课程，并颁发相应的结业证书，这些机构或学会通常具有一定的权威性和专业性，可以为学员提供较为系统和全面的培训内容和教学支持。
家庭教育指导师证书的颁发机构比较多，涵盖了政府机关、职业技能鉴定机构、人才市场等多个领域，不同机构颁发的证书在法律效力上是相同的，但在社会认可度和含金量上可能会有所不同，在选择家庭教育指导师培训机构时，建议考生要综合考虑各方面因素，选择具有良好声誉和较高水平的机构进行学习和考试。
