健康管理师证书是由多个国家和地区的专业机构颁发的，主要包括以下几个方面的机关：
1、中国国家卫生健康委员会(National Health Commission of the People's Republic of China,简称NHC):中国国家卫生健康委员会是中华人民共和国国务院组成部门，负责全国卫生健康工作的领导和管理，获得健康管理师证书需要通过国家卫生健康委员会组织的统一考试和评审，考试合格后，由国家卫生健康委员会颁发健康管理师资格证书。
2、中国疾病预防控制中心(China CDC):中国疾病预防控制中心是中国政府的重要组成部分，负责全国疾病预防控制、健康教育、健康促进等工作，获得健康管理师证书的人需要在完成相关培训后，向中国疾病预防控制中心申请颁发证书。
3、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各级卫生健康委员会在国家卫生健康委员会的指导下，负责本行政区域内的卫生健康工作，各省、自治区、直辖市卫生健康委员会也会组织健康管理师的考试和评审工作，并颁发相应的证书。
4、国际公共卫生学院联盟(Global Alliance for Public Health Edution):这是一个国际性的公共卫生教育机构联盟，旨在促进全球公共卫生教育的发展，部分国际公共卫生学院联盟认证的健康管理师课程也会颁发证书。
5、其他国内外专业机构：除了上述几个主要的机关外，还有一些国内外的专业机构也会颁发健康管理师证书，美国心脏协会(Amerin Heart Association,简称AHA)提供的健康管理师培训和认证项目；加拿大皇家医学院(Royal College of Physicians of Canada)提供的注册健康教练计划(Registered Health Coh Program)等，这些机构的证书在国际上具有一定的认可度，但在中国的认可程度相对较低。
获得健康管理师证书的途径有很多，不同的机关和机构都有自己的认证标准和程序，获得健康管理师证书的主要途径是通过国家卫生健康委员会组织的统一考试和评审，以及各省、自治区、直辖市卫生健康委员会的本地考核，一些国际性和专业性较强的健康管理师课程也会颁发证书，但在中国的认可程度相对较低，在选择健康管理师课程时，建议考生充分了解各个机关和机构的认证情况，以便更好地规划自己的职业发展道路。
